Fontilles, amb la creació i posada en marxa del sanatori San Francisco de Borja (Alacant), va tindre un paper fonamental en el control de la lepra a Espanya. A finals dels anys setanta, a mesura que la lepra deixa de ser un problema de salut pública a Espanya, es decideix aprofitar els seus recursos i experiència per a lluitar contra aquesta malaltia en aquells països on continua sent un important problema de salut, principalment Índia i Brasil. Més tard, en 2002, Fontilles amplia el seu camp de treball a la lluita contra altres malalties (úlcera de Buruli a Costa de Marfil) i a projectes de salut comunitària.
En l’actualitat, recolzem 23 projectes de cooperació sanitària en diferents països d’Amèrica Llatina, Àsia i Àfrica, amb un objectiu comú: lluitar contra les malalties oblidades, prioritzant l’atenció integral de les persones, amb la fi última d’erradicar la pobresa en el món.
Per a dur a terme aquesta labor, Fontilles estableix aliances amb altres organitzacions amb les mateixes finalitats per a ser més efectius. Així, som membres de la Coordinadora Espanyola de ONGD des de l’any 2006 i de la Coordinadora Valenciana de ONGD des de l’any 1996. Des de l’any 1969, formem part també de la Federació Internacional de ONGD de Lluita contra la Lepra (ILEP); des de l’any 2013, del consorci de ONGD signataris de la Declaració de Londres per a la Lluita contra les ETDs i, des de l’any 2015, de la Xarxa Internacional de ONGD de Lluita contra Malalties Tropicals Desateses (NNN).
